Кроме кормушек-фидеров не знаю других вариантов затаптывания сена. Рулоны и скирды с сеном раньше оборачивали сеткой с размером ячеек таким, чтобы копыто никак попасть не могло, тогда тягали потихоньку и лошади, и овцы и отходов было очень мало. Сейчас (пока еще, там посмотрим) рулоны не ставим. Все сенные отходы сжигаем, чтобы не мокли и не гнили.
По топким левадам, как показала практика, спасают только отвод воды канавками + ивы по стороне низинки + травосмеси с очень хорошей корневой системой, если левады травяные, конечно. И то не до конца спасают, у выхода все равно пришлось делать землю жестче. Для насыпных левад даже не знаю, наверное только хороший дренаж. Я бы выбирала грунт, туда геотекстиль и послойно камешки от крупной до мелкой фракции, разделяя спец.сеткой какой-нить или тем же геотекстилем, а потом уже насыпной грунт, который будет выше уровня остальной земли. Как-то так наверное.
По ножкам, да, думаю, что застойные явления. Понаблюдаем пару дней, все должно быть хорошо.