Решить, что Вам надо - крови или спокойствие. Тут Вам одной решать, и взвешивать всё - здоровье лошади, последствия, и что Вам самой дороже. Если жеребец настолько ценен - конечно, целесообразно его жеребцом и оставить. Если нет - смотрите кто в принципе спокойней как жеребец, кастрируйте более "неспокойного". Вообще мне кажется эту проблему стоит решать так же, консультируясь со своим ветеринаром. Мы же тут не знаем всех подробностей...
И "здоровье изрядно подпорчено" - это насколько?